Pada tahun 1964 berlangsung Konferensi YPPII pertama di Wisma Baitani, Nongkojajar.  Konferensi ini menjadi awal dari Kebaktian Tahunan Nasional YPPII Batu yang masih berlangsung hingga saat ini.   Berikut tema-tema yang terdokumentasi dari 1973 – 2021:

KT 1973  “Missio Dei – Pengutusan Allah”

KT 1974  “Bekerja Selama Siang”

KT 1975  “Bersaksi Pada Zaman Akhir”

KT 1976  “Bukalah Kiranya Matamu”

KTN 1979  “Keluarga Kristen Ditengah-tengah Dunia Masa Kini”

KTN 1980  “Kamu Bukan Milikmu Sendiri”

KTN 1981  “Salib Kristus Titik Balik Kehidupan Manusia”

KTN 1982  “Pelayanan Roh Kudus Masa Kini”

KTN 1983  “Biarlah UmatKu Bertumbuh”

KTN 1984  “Bercahaya Seperti Bintang-Bintang di Dunia”

KTN 1985  “Pujilah Tuhan Hai Jiwaku” (Yubelium)

KTN 1986  “Semua Bangsa Akan Sujud Menyembah Tuhan”

KTN 1987  “Called to Serve The Lord Together” (Asian Mission Consultation)

KTN 1988  “Menyembah Dalam Roh dan Kebenaran”

KTN 1989  “Nubuatan Akhir Zaman”

KTN 1990  “Jadilah Berkat”

KTN 1991  “Kesaksian Kristen di Tengah-Tengah Modernisasi”

KTN 1992  “Roh Kudus di Tengah Zaman yang Berubah”

KTN 1993  “Hidup yang Diurapi dan Diberkati Tuhan”

KTN 1994  “Doa Puasa dan Kuasa Tuhan”

KTN 1995  “Perjuangan Rohani Melawan Kuasa-Kuasa Kegelapan Zaman Ini”

KTN 1996  “Tantangan dan Kesempatan Bagi Orang Percaya Dalam Abad XXI”

KTN 1997  “Hidup Yang Berkelimpahan”

KTN 1998  “Mempersiapkan Orang Percaya Menghadapi Krisis Abad XXI

KTN 1999  “Setia Sampai Akhir”

KTN 2000 “Lebih dari Pemenang”

KTN 2001  “Allah Sanggup”

KTN 2002  “Hidupku untuk Tuhan dan Sesama”

KTN 2003  “Mengikuti Pimpinan Roh Kudus Senantiasa”

KTN 2004  “Keluarga Kristen Di Tengah Tantangan Zaman”

KTN 2005  “Allah Bersemayam Di Atas Puji-Pujian”

KTN 2006  “Kemuliaan Dalam Penderitaan”

KTN 2007  “Pulihkanlah Kami, Ya Tuhan”

KTN 2008  “Berbahagialah Orang Yang Membawa Damai”

KTN 2009  “Janji-Nya Pasti Digenapi”

KTN 2010  “Jadilah Berkat”

KTN 2011  “Tuhan Pasti Pulihkan”

KTN 2012  “Haleluya! Pujilah Tuhan, Hai Jiwaku!”

KTN 2013  “Rayakan Tahun Kesejahteraan” (KTN ke-50: YUBILUM)

KTN 2014  “Manusia Tuhan”

KTN 2015  “Waktu Tuhan”

KTN 2016  “Ladang Sudah Menguning“

KTN 2017  “Kasih Allah Yang Memulihkan“

KTN 2018  “Bangkit Dan Mengemban Kesejahteraan Bangsa-Bangsa”

KTN 2019  “Disini Aku Berpijak (Here I Stand)”

KTN 2020   “Dilengkapi Untuk Melengkapi Generasi Emas Bagi Allah”

KTN 2021  “Mengalirkan Kasih Allah Bagi Dunia”